扶余市博物馆成立于1984年，其前身为1983年成立的扶余县展览馆。扶余市博物馆随县级行政区划改革曾名为扶余县博物馆（1984年—1987年10月）、扶余市博物馆（1987年11月—1992年5月）、扶余区博物馆（1992年6月—1995年8月）、扶余县博物馆（1995年9月—2013年3月）、扶余市博物馆（2013年4月—现在）。扶余文物工作在1983年以前由县毛泽东思想宣传站（县文化馆）管理。1983年成立扶余县展览馆，隶属于扶余县文化局，核定编制6人，同年县图书馆成立，由图书馆内设专职文物干部1人管理全县文物工作。1984年扶余县展览馆改名为扶余县博物馆，主管全县的文博工作。扶余县博物馆的成立，使扶余文博事业具有了专门的管理机构和管理人员，开启了扶余文物保护、收藏、研究、展示等工作新的篇章。

   自扶余县博物馆成立到2012年初，扶余博物馆一直位于今松原市宁江区长宁南街21号（1995年扶余县治所移至三岔河镇至2012年期间在宁江区原馆址异地办公）。1984年—2000年博物馆馆舍为1968年建设的平面式山字形砖木结构建筑，屋顶为起脊式，

总占地面积2500平方米，建筑面积1954平方米。2001年，因松原市城市建设需要，把博物馆原临街房无偿拆除。经扶余县政府、文体局同意，博物馆租房进行办公，一间做库房，一间为值宿室和办公室。在此同时，扶余县政府、文体局又与宁江区文体局达成协议，宁江区文体局负责在原博物馆址建新楼，随后博物馆回迁1—4楼，馆舍占地面积150平方米，建筑面积600平方米。

   扶余市博物馆现座落于扶余市太祖路与和平街交汇处，馆舍于2010年开工建设，同年竣工，投资2000余万元。2012年11月扶余县博物馆由松原市宁江区搬迁至现址,结束了异地办公的历史。扶余市博物馆现占地面积约3000平方米（周边建设公共停车场,共有停车位94个），建筑面积6000平方米，实际使用面积4000平方米，主体建筑为东向三层框架式结构，建筑高度15米，展厅和办公区正面外墙为钢化玻璃幕墙。室内每层南侧椭圆形展厅建筑面积为1500平方米，北侧矩形为办公区域建筑面积500平方米。2015年5月市政府拟投资800余万元进行博物馆内部重新装修布展，在一楼装修布置城市规划展，二楼装修布置扶余市文物陈列展览，每层展厅面积约1200平方米，充分利用声、光、电达到图文、实物、模型展示效果。2016年4月完成装修布展并免费开放。至此实现了扶余市博物馆、扶余市辽金历史文物陈列馆两地同时免费开放，接待公众参观。

常设陈展：

《扶余市历史文物陈列展览》；文物陈列展厅按照从古至今的顺序划分为四个展区；第一展区为战国秦汉时期，有代表性的展出文物有半两和五铢钱币、红衣陶壶等；第二展区为辽金时期，展出文物有铜镜、六耳铁锅等；第三展区为元明清时期，展出文物有龙泉窑大碗、五彩瓷盘等；第四展区为近现代时期，展出文物有清花瓷罐、底部印有“奉天省 太清宫 丁丑年 传钵式”字样的锡钵；从旧石器时代到中华人民共和国成立，共展出不同时期各类文物300多件。
  夫余——扶余，一步步从远古走来，带着早期土地开发的尘沙，带着部族战争的创痛，带着兼融各部族文化而形成的地域文化的厚重积淀，一步步，一直走到了今天。让我们从新走回远古，从古濊貊人原始的渔猎生活的年代开始，去追寻夫余行进的足音，去感受我们的故乡成长的历史。

临时展览：

《扶余市老照片展览》

展览主要是为了发挥博物馆展出和社会教育的功能，从而达到服务社会的目地。同时也为了唤起已经步入晚年的老扶余人温热的年轻记忆。铭记他们书写的历史，支撑的年代，通过图片展示，老人的记忆，让当代年轻人更加珍惜今天所拥有的一切，更加珍爱为扶余奉献一生的老人们。激发起青年一代的昂扬斗志和奉献精神，聚焦正能量，建设和谐社会。

扶余市博物馆现有馆藏文物7548件。其中瓷器441件； 陶器58件；玉器、玉石14件；铜器145件；金银器35件；铁器、其他金属器95件；石刻、石器、砖瓦54件；书法、绘画3件；玺印符牌3件；钱币6417件；骨角牙器22件；竹木雕3件；武器174件；文件、宣传品7件；档案文书1件、玻璃器18件；标本、化石57件；其他1件。按级别划分：二级文物7件，三级28件，一般文物7513件。

这些文物，既有上至二万年前的古动物化石、新石器时期的石斧，也有省内少见的战国至汉代的红衣陶壶，全国罕见的辽代钱币及辽金铜镜、官印，还有省内县级博物馆馆藏文物较多的元、明、清瓷器。