曹县商都博物馆成立于2007年8月，座落于县文化中心，隶属于县文化体育局。是一处集收藏、陈列、研究、社会教育于一体的综合类博物馆，常年免费对外开放，在传播商文化方面发挥了重要作用。馆内文物藏品1674件/套，化石藏品1件，其中一级文物3件，二级文物3件，三级文物108件。馆藏各类精美玉器200余件，在数量和质量上居全市前列，宋玉象和北魏甪端玉兽均为一级文物。展室面积800平方米，常年展陈“馆藏文物精品展”，展品200余件，分为石器、陶器、青铜器、瓷器、玉器、字画、革命文物七大类。

2007年1月，经曹县编制委员会批准成立曹县商都博物馆。

2007年8月，博物馆在曹县经济开发区正式开馆。

2014年，被菏泽市委宣传部批准为市级爱国主义教育基地。

2015年7月，搬迁至县文化中心三楼。

2017年4月，在博物馆内开辟专门区域打造文创展厅。

馆内常年展陈“馆藏文物精品展”，展品200余件，分为石器、陶器、青铜器、瓷器、玉器、字画、革命文物七大类。

石器展厅

陶器展厅

青铜器展厅

瓷器展厅

玉器展厅

革命文物展厅

字画展厅

文创展厅

藏品分为石器、陶器、青铜器、瓷器、玉器、字画、革命文物七大部分。馆内文物藏品1674件/套，化石藏品1件，其中一级文物3件（宋玉象、北魏甪端玉兽和元直耳盘口龙纹人物酱釉瓷香炉），二级文物3件，三级文物108件。

曹县商都博物馆设置有办公室、值班室。展厅有石器展区、瓷器展区、玉器展区、青铜器展区、民风民俗艺术品展区、书画展区等。参观时注意展品不能随便触碰，不能大声喧哗吵闹，拍照不能使用闪光灯。博物馆提供免费讲解服务。